Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms