Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SIN3AQ96ST3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms