Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms