Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHIPQ96QV1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms