Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms