Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms