Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf85Q96MD7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf85Q96MD7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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