Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF354BQ96LW1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms