Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM47Q96LD4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms