Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPGRIP1Q96KN7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms