Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEURL4Q96JN8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms