Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUCLG2Q96I99 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms