Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms