Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms