Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNFT2Q96EX2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms