Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms