Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX17Q92841 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms