Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS9Q8WXC6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS9Q8WXC6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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