Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms