Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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