Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMFBP1Q8TBY8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMFBP1Q8TBY8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms