Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms