Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms