Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM3Q8NE01 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM3Q8NE01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM3Q8NE01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNNM3Q8NE01 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM3Q8NE01 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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