Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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