Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATAD1Q8NBU5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD1Q8NBU5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms