Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms