Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMTC2Q8N394 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC2Q8N394 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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