Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms