Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP6Q7Z6E9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms