Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP34Q70CQ2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms