Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL17Q6UXB2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms