Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C6orf89Q6UWU4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C6orf89Q6UWU4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms