Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A1Q6PCB7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A1Q6PCB7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A1Q6PCB7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A1Q6PCB7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A1Q6PCB7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms