Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRT80Q6KB66 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms