Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD40Q6AI12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms