Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms