Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms