Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms