Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms