Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM78Q5T7P6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms