Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COLEC12Q5KU26 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms