Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF6Q58WW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF6Q58WW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms