Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AB3PQ58FF7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB3PQ58FF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms