Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms