Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LACTB2Q53H82 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LACTB2Q53H82 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms