Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms