Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4orf17Q53FE4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms