Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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