Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGSM1Q2NKQ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM1Q2NKQ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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